Ready to Load Sequencing

Nutzen Sie unsere Sequenzierkapazitäten für Ihre Ready-to-Load-Librarys

CeGaT bietet die Sequenzierung von individuell erstellten Librarys an, die mit Illumina- oder PacBio-Systemen kompatibel sind. Dabei setzen wir die neuesten Sequenziertechnologien ein. Je nach Bedarf werden die Proben entweder auf Illumina Short-Read-Plattformen, wie dem NovaSeq X Plus, NovaSeq 6000 oder MiSeq, oder auf dem PacBio Sequel IIe Long-Read-System sequenziert.

Es stehen flexible Sequenzieroptionen zur Verfügung, die speziell auf Ihr Projekt zugeschnitten sind. Weitere Einzelheiten entnehmen Sie bitte unseren technischen Informationen.

CeGaT ist der beste Partner für Ihr Sequenzierprojekt

Hohe
Flexibilität

Skalierbar für unterschiedliche Probenarten, Probenmengen und Probenanforderungen

Akkreditierte
Verfahren

Bearbeitung nach
höchsten Qualitätsstandards

Hervorragender Kundenservice

Wissenschaftliche Begleitung bei allen Projektschritten

Qualität aus Deutschland

Hausinterne Bearbeitung aller Proben zur Einhaltung unserer zuverlässigen und bewährten Qualität

Unser Engagement für Sie

Schnelle Bearbeitung

Bearbeitungszeit
≤ 15 Werktage

Hohe Qualität

Höchste Genauigkeit bei allen Prozessen

Sichere Datenlieferung

Sichere Bereitstellung der sequenzierten Daten über hausinterne Server

Sichere Aufbewahrung

Sichere Proben- und Datenaufbewahrung nach Projektabschluss

Unser Service

Uns ist eine umfangreiche und erstklassige Projektbegleitung wichtig − von der Auswahl des passenden Produktes bis zur Auswertung der Daten. Jedes Projekt wird von einer engagierten Wissenschaftlerin oder einem engagierten Wissenschaftler begleitet, so dass Ihnen während des gesamten Projektverlaufs eine Ansprechpartnerin oder ein Ansprechpartner zur Seite steht.

Unser Service umfasst:

  • Ausführliche Projektberatung
  • Produktauswahl abgestimmt auf Ihr Projekt
  • Umfangreiche bioinformatische Auswertung Ihrer Daten
  • Abschließender und detaillierter Projektbericht mit Informationen zur Probenqualität, Sequenzierparametern, bioinformatischen Analysen und Ergebnissen

Profitieren Sie von unserem hervorragenden Support und unseren akkreditierten Arbeitsabläufen.

Unser Produktportfolio für Ready to Load Sequencing

Wir bieten verschiedene Ready-to-Load-Sequenzieroptionen für eine Vielzahl von Forschungsfragen an. Es stehen verschiedene Systeme, Flow Cells und Sequenzieroptionen zur Verfügung.

NovaSeq X Plus Plattform (Illumina)

10B Flow cell

SR/PE

200 Zyklen

2000 Gb

SR/PE

300 Zyklen

3000 Gb

SR: Single-Read; PE: Paired-End

NovaSeq 6000 Plattform (Illumina)

SP Flow cell

S1 Flow cell

S2 Flow cell

S4 Flow cell

SR/PE

100 Zyklen

65 Gb

650 Millionen Single-Reads CPF*

SR/PE

100 Zyklen

134 Gb

1330 Millionen Single-Reads CPF*

SR/PE

100 Zyklen

333 Gb

3335 Millionen Single-Reads CPF*

SR/PE

200 Zyklen

1600 Gb

8000 Millionen Single-Reads CPF*

SR/PE

200 Zyklen

134 Gb

650 Millionen Single-Reads CPF*

SR/PE

200 Zyklen

266 Gb

1330 Millionen Single-Reads CPF*

SR/PE

200 Zyklen

667 Gb

3335 Millionen Single-Reads CPF*

SR/PE

300 Zyklen

2400 Gb

8000 Millionen Single-Reads CPF*

SR/PE

300 Zyklen

200 Gb

650 Millionen Single-Reads CPF*

SR/PE

300 Zyklen

400 Gb

1330 Millionen Single-Reads CPF*

SR/PE

300 Zyklen

1000 Gb

3335 Millionen Single-Reads CPF*

PE

500 Zyklen

325 Gb

650 Millionen Single-Reads CPF*

SR: Single-Read; PE: Paired-End; CPF: Clusters Passing Filter
*Im Falle der PE-Sequenzierung ist die Zahl doppelt so hoch.

MiSeq Plattform (Illumina)

Nano Flow cell

Micro Flow cell

V2 Flow cell

V3 Flow cell

SR/PE

300 Zyklen

0,3 Gb

1 Million Single-Reads CPF*

SR/PE

300 Zyklen

1,2 Gb

4 Millionen Single-Reads CPF*

SR/PE

50 Zyklen

0,75 Gb

12 Millionen Single-Reads CPF*

SR/PE

150 Zyklen

3,3 Gb

22 Millionen Single-Reads CPF*

PE

500 Zyklen

0,5 Gb

1 Millionen Single-Reads CPF*

SR/PE

300 Zyklen

4,5 Gb

12 Millionen Single-Reads CPF*

SR/PE

600 Zyklen

13,2 Gb

22 Millionen Single-Reads CPF*

PE

500 Zyklen

7,5 Gb

12 Millionen Single-Reads CPF*

SR: Single-Read; PE: Paired-End; CPF: Clusters Passing Filter
*Im Falle der PE-Sequenzierung ist die Zahl doppelt so hoch.

Sequel IIe Plattform (PacBio)

SMRT Cell 8M

Movie Time – 10-30 Std. (abhängig von der Insert-Länge)

3 Millionen HiFi Reads

Abhängig von der Länge des Library-Inserts, der Movie Time und der Probenqualität.

Bioinformatik

Je nach verwendeter Sequenzierplattform unterscheiden sich die gelieferten Datenformate. Für Short-Read-Sequenzierprojekte erhalten Sie entweder Rohdaten als BCL-Dateien oder FASTQ-Dateien nach dem Demultiplexing. Falls erforderlich kann ein Adapter-Trimming durchgeführt werden. Bei Sequenzierprojekten, die mit dem PacBio-System durchgeführt werden, erhalten Sie HiFi Reads als geklippte BAM-Dateien oder FASTQ-Dateien.

Unser Prozessablauf

Icon Prozessablauf

Support &
Angebot

Support & Angebot

Icon zur Darstellung eines Prozessablaufs
Icon Prozessablauf

Probeneingang & Qualitätskontrolle

Icon zur Darstellung eines Prozessablaufs
Icon Prozessablauf

Vorbereitung der Library & Sequenzierung

Icon zur Darstellung eines Prozessablaufs
Icon Prozessablauf

Bioinformatische Analysen & Datenversand

Technische Information

Die Sequenzierung wird bei uns mit Illumina- oder PacBio-Sequenzierplattformen durchgeführt. Für Sequenzierprojekte auf den Illumina-Plattformen akzeptieren wir jede kompatible Library. Dabei können Sie sowohl Illumina-Index-Sequenzierprimer als auch Ihre eigenen Primer verwenden. Wenn Sie die Zielmoleküle für die Library mit einem kommerziellen, PCR-basierten Kit für Unique molecular Identifier (UMIs) generiert haben, können wir die Sequenzierung mit angepassten Sequenzierparametern anbieten. Die Längen von Read 1 und Read 2, sowie die Index-Leselängen, können an Ihre Bedürfnisse angepasst werden.

Für die Durchführung von HiFi-Long-Read-Sequenzierprojekten akzeptieren wir Sequenzier-Librarys, die mit dem SMRTbell Prep Kit 3.0 hergestellt wurden. Wenn Sie möchten, dass wir die Vorbereitung der SMRTbell-Library mit Ihren fertigen DNA-Proben (gescherte/ gereinigte DNA) durchführen, teilen Sie uns dies bitte mit, damit wir die Möglichkeiten besprechen können.

Entdecken Sie unser Ready-to-Load-Sequencing-Produktportfolio mit verschiedenen Sequenzieroptionen für Ihre Sequenzier-Library. Abhängig von der Batch-Größe, dem gewünschten Output und den Spezifikationen für die Read-Anzahl können Sie aus unserem Portfolio frei wählen.

Downloads

Ready to Load Sequencing Flyer (DE)
Performance des NovaSeq™ X Plus

Kontaktieren Sie uns

Sie haben noch Fragen oder Interesse an unserem Service? Treten Sie gern mit uns in Kontakt. Wir werden uns schnellstmöglich um Ihr Anliegen kümmern.

Starten Sie Ihr Projekt mit uns

Gerne beraten wir Sie zu unseren Sequenzierdienstleitungen und erarbeiten mit Ihnen gemeinsam die beste Lösung, die auf Ihre klinische Studie oder Forschungsprojekt abgestimmt ist.

Bitte geben Sie, falls möglich, folgende Probeninformationen an: Ausgangsmaterial, Anzahl der Proben, bevorzugte Option für die Vorbereitung der Library, bevorzugte Sequenziertiefe und gewünschte bioinformatische Analysestufe.