Der T-Zell-Rezeptor (“T-cell receptor”, TCR) befindet sich auf der Oberfläche von T-Zellen. Er ist wichtig für die Erkennung von Antigenen, die von den Molekülen des Haupthistokompatibilitätskomplexes (“major histocompatibility complex”, MHC) auf Antigen-präsentierenden Zellen dargeboten werden. Durch somatische Neuanordnungen exprimieren T-Zellen eine breite Palette einzigartiger Rezeptoren. Diese sehr diversen Heterodimere bestehen meist aus zwei Untereinheiten, der α- und β-Kette. Zu einem geringen Prozentsatz bestehen die Heterodimere aber auch aus einer γ- und δ-Kette. Die α- und γ-Ketten des TCR entstehen durch V/J-Rekombination, die aus zufälligen Umlagerungen der variablen (V) und verbindenden (“joining”, J) Gene resultiert. Die β- und δ-Ketten entstehen durch V/D/J-Rekombination, die zusätzlich die Diversitätsgene (D) einschließen.
Das individuelle T-Zell-Rezeptor-Repertoire wird also durch V/D/J-Rekombination geformt. Das Ergebnis dieser Rekombination ist eine besonders diverse Antigenbindungsstelle, die auch Complementarity-determining Region 3 (CDR3) genannt wird. Diese Region ist ein attraktives Ziel, um die Vielfalt des TCR-Repertoires zu bewerten, da sie für jede TCR-β-Variante einzigartig ist.
Die Untersuchung des TCR-Repertoires:
- liefert Einblicke in die Funktionen von T-Zellen bei der Immunantwort, z. B. bei der Immunsuppression,
- ermöglicht das Überwachen von Arzneimitteltherapien, wie z. B. Immuntherapien bei Krebs, und der damit verbundenen Veränderung des T-Zell-Status,
- und hilft die personalisierte Medizin durch die Analyse tumor-infiltrierender T-Zellen zu verbessern.
Wir bieten TCR Sequencing zur Untersuchung des T-Zell-Rezeptor-Repertoires an. Wir liefern Informationen über Diversität, Klonalität und Veränderungen im TCR-Repertoire oder einzelner TCR-Klone (TCR Clone Tracking) zu unterschiedlichen Zeitpunkten.
CeGaT ist der beste Partner für Ihr Sequenzierprojekt
Unser Engagement für Sie
Schnelle Bearbeitung
Bearbeitungszeit
≤ 15 Werktage
Hohe Qualität
Höchste Genauigkeit bei allen Prozessen
Sichere Datenlieferung
Sichere Bereitstellung der sequenzierten Daten über hausinterne Server
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Sichere Proben- und Datenaufbewahrung nach Projektabschluss
Unser Service
Uns ist eine umfangreiche und erstklassige Projektbegleitung wichtig − von der Auswahl des passenden Produktes bis zur Auswertung der Daten. Jedes Projekt wird von einer engagierten Wissenschaftlerin oder einem engagierten Wissenschaftler begleitet, so dass Ihnen während des gesamten Projektverlaufs eine Ansprechpartnerin oder ein Ansprechpartner zur Seite steht.
Unser Service umfasst:
- Ausführliche Projektberatung
- Produktauswahl abgestimmt auf Ihr Projekt
- Umfangreiche bioinformatische Auswertung Ihrer Daten
- Abschließender und detaillierter Projektbericht mit Informationen zur Probenqualität, Sequenzierparametern, bioinformatischen Analysen und Ergebnissen
Profitieren Sie von unserem hervorragenden Support und unseren akkreditierten Arbeitsabläufen.
Unser Produkt für T-Cell Receptor Sequencing
Wir bieten T-Cell Receptor Sequencing (TCR) auf RNA-Ebene an, um Sie bei einer Vielzahl von Forschungsfragen zu unterstützen. Wünschen Sie zusätzlich zu den beinhalteten Leistungen bioinformatische Analysen Ihrer Daten? Jedes unserer Produkte kann durch weitere Dienstleistungen ergänzt werden. Wir beraten Sie gerne.
TCR RNA |
Spezies |
Probenart |
Ziel |
Ziel-Untereinheit |
Sequenzierplattform |
Output |
Beinhaltete Leistungen |
Bioinformatik
Die Rohdaten der Sequenzierung werden automatisch verarbeitet. Wir bieten verschiedene Level bioinformatischer Analysen an. Das Standardlevel ist Level 1. Mit steigendem Bioinformatiklevel werden mehr Daten geliefert. Alle höheren Level beinhalten dabei die Daten der vorherigen Level. Zusätzlich zu den Daten und unabhängig vom Analyselevel wird ein Projektbericht verfasst.
Level 1:
- Demultiplexing und Adapter-Trimming der Sequenzierdaten (FASTQ-Datei)
Level 2:
- Rekonstruktion der TCR-Klone
- Beurteilung von Klonalität und Diversität (TSV- und PNG-Datei)
Weitere Optionen für bioinformatische Analysen sind auf Anfrage erhältlich, darunter:
- TCR-Klon-Tracking
- Veränderungen des Repertoires über mehrere Zeitpunkte hinweg
Technische Information
Wir bieten T-Cell Receptor Sequencing der CD3-Region der TCR β-Kette an. TCR RNA gibt Aufschluss über das Expressionsniveau des TCR-Repertoires.
Bei CeGaT wird die Paired-End-Sequenzierung (2 x 100 bp) mit den Sequenzierplattformen von Illumina durchgeführt. Wenn Sie andere Sequenzierparameter benötigen, lassen Sie es uns gerne wissen! Wir können Ihnen weitere Lösungen anbieten.
Weitere Informationen zu T-Cell Receptor Sequencing
Der T-Zell-Rezeptor wurde erstmals in den 1980er Jahren mit Hilfe monoklonaler Antikörper isoliert. Seitdem wird seine Funktion im menschlichen Körper untersucht. Der T-Zell-Rezeptor ist ein heterodimerer Proteinkomplex, der aus einer α- und einer β-Kette besteht. Diese beiden Ketten sind über eine Disulfidbrücke verbunden und bilden eine Antigenbindungsstelle im extrazellulären Raum. Neben der α- und β-Kette bilden die variable Region (V-Region), die konstante Region (C-Region), das Transmembranprotein CD3 und zwei ζ-Polypeptide (Zeta) den finalen T-Zell-Rezeptor-Komplex. Nur etwa 5 % aller menschlichen T-Zell-Rezeptoren bestehen nicht aus einer α- und einer β-Kette, sondern aus einer γ- und einer δ-Kette.
Die Loci, die für die α- und β-Kette des T-Zell-Rezeptors kodieren, befinden sich auf den Chromosomen 14 bzw. 7. Jede dieser Ketten wird von Loci kodiert, die mehrere Gensegmente enthalten: V und J für die α-Kette und V, D, und J für die β-Kette. Jedes Gensegment ist in verschiedenen Versionen vorhanden. Bei der somatischen Rekombination werden die Segmente zufällig ausgewählt und kombiniert. Während des Rekombinationsschritts können Basen hinzugefügt oder gelöscht werden, was die Vielfalt noch weiter erhöht. Jede reife T-Zelle hat genau eine rekombinierte α- und β-Kette. Beide Ketten werden unabhängig voneinander transkribiert und übersetzt.
Anschließend werden sie miteinander verbunden, um einen vollständigen T-Zell-Rezeptor zu bilden. Die variable Region, die durch somatische Rekombination entsteht, ist direkt an der Antigenbindung beteiligt.
Die Gesamtheit aller T-Zell-Rezeptoren in einer Probe wird auch als T-Zell-Rezeptor-Repertoire bezeichnet. Die Analyse dieses T-Zell-Rezeptor-Repertoires hat ein breites Spektrum an Auswirkungen und Anwendungen. Die Sequenzierung von T-Zell-Rezeptoren (“T-cell receptor sequencing”) kann das Verständnis verschiedener Krankheiten wie Krebs, Infektionskrankheiten, Autoimmunerkrankungen oder Alterungsprozesse verbessern. Die Sequenzierung der T-Zell Rezeptoren kann Einblicke in die Funktion von T-Zellen geben, zum Beispiel im Zusammenhang mit Immunsuppression. Darüber hinaus kann die Sequenzierung von T-Zell-Rezeptoren zur Überwachung von Arzneimitteltherapie eingesetzt werden, z. B. im Zusammenhang mit Krebs. Ein Anwendungsbeispiel für die Überwachung von Arzneimitteltherapien durch T-Zell-Rezeptor-Sequenzierung sind Krebsbehandlungen, z. B. Immuntherapien, und damit verbundene Veränderungen des T-Zell-Rezeptor-Status. Darüber hinaus werden durch die T-Zell-Rezeptor-Sequenzierung Ansätze der personalisierten Medizin erleichtert.
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Bitte geben Sie, falls möglich, folgende Probeninformationen an: Ausgangsmaterial, Anzahl der Proben, bevorzugte Option für die Vorbereitung der Library, bevorzugte Sequenziertiefe und gewünschte bioinformatische Analysestufe.
