Das humane Leukozyten-Antigen-System (HLA-System) umfasst eine Gruppe von Genen, die eine wichtige Funktion im menschlichen Immunsystem haben. Die HLA-Region ist stark polymorph und enthält sechs klassische HLA-Gene: Klasse I mit HLA-A, -B und -C und Klasse II mit HLA-DRB1, -DQB1 und -DPB1. Der HLA-Bereich ist mit mehr als 100 multifaktoriellen, komplexen Krankheiten assoziiert, vor allem mit der Pathogenese von Entzündungen und Autoimmunerkrankungen. Um mehr über die Funktionen und komplexen Interaktionen des HLA-Systems herauszufinden, kann die HLA-Typisierung auf der Grundlage von Next-Generation Sequencing (NGS) sehr hilfreich sein.
Die Anwendungsbereiche der HLA-Typisierung sind vielfältig:
- Unterstützung bei der Beurteilung des individuellen Therapieansprechens, einschließlich der Pharmakogenetik
- Bereitstellung wichtiger Informationen für die Immuntherapie zur Bekämpfung von Krebs
- Abgleich von HLA-Regionen einer spendenden und einer empfangenden Person für eine Transplantation
Wir bieten verschiedene HLA-Typing-Produkte an, um Ihre Forschungsfragen zu beantworten.
CeGaT ist der beste Partner für Ihr Sequenzierprojekt
Unser Engagement für Sie
Schnelle Bearbeitung
Bearbeitungszeit
≤ 15 Werktage
Hohe Qualität
Höchste Genauigkeit bei allen Prozessen
Sichere Datenlieferung
Sichere Bereitstellung der sequenzierten Daten über hausinterne Server
Sichere Aufbewahrung
Sichere Proben- und Datenaufbewahrung nach Projektabschluss
Unser Service
Uns ist eine umfangreiche und erstklassige Projektbegleitung wichtig − von der Auswahl des passenden Produktes bis zur Auswertung der Daten. Jedes Projekt wird von einer engagierten Wissenschaftlerin oder einem engagierten Wissenschaftler begleitet, so dass Ihnen während des gesamten Projektverlaufs eine Ansprechpartnerin oder ein Ansprechpartner zur Seite steht.
Unser Service umfasst:
- Ausführliche Projektberatung
- Produktauswahl abgestimmt auf Ihr Projekt
- Umfangreiche bioinformatische Auswertung Ihrer Daten
- Abschließender und detaillierter Projektbericht mit Informationen zur Probenqualität, Sequenzierparametern, bioinformatischen Analysen und Ergebnissen
Profitieren Sie von unserem hervorragenden Support und unseren akkreditierten Arbeitsabläufen.
Unser Produktportfolio für HLA Typing
Je nach Qualität des Ausgangsmaterials bieten wir verschiedene HLA-Typing-Produkte an. Wünschen Sie zusätzlich zu den beinhalteten Leistungen bioinformatische Analysen Ihrer Daten? Jedes unserer Produkte kann durch weitere Dienstleistungen ergänzt werden. Wir beraten Sie gerne.
HLA Classic | HLA Flex |
Spezies | Spezies |
DNA-Qualität | DNA-Qualität |
HLA-Typ | HLA-Typ |
Sequenzierplattform | Sequenzierplattform |
Output | Output |
Beinhaltete Leistungen | Beinhaltete Leistungen |
Bioinformatik
Unsere Typisierung der HLA Klassen I und II basiert auf Whole Exome Sequencing (WES). Für die Datenauswertung wird ein spezieller Algorithmus verwendet. Sie erhalten die Ergebnisse der HLA-Typisierung als TSV-Datei, zusammen mit den zuvor erstellten WES-Daten, einschließlich der Daten nach Demultiplexing und Adapter-Trimming (FASTQ-Dateien).
Zusätzlich zur HLA-Typisierung können wir Ihnen gerne weitere bioinformatische Analysen für die Exomdaten anbieten. Hier finden Sie unsere bioinformatischen Optionen für zusätzliche WES-Datenanalysen.
Technische Information
Die Ergebnisse der HLA-Typisierung werden auf der Datengrundlage von Whole Exome Sequencing (WES) mithilfe eines speziellen bioinformatischen Algorithmus erstellt.
Die folgenden Loci werden analysiert:
- HLA-Klasse I (HLA-A, -B und -C) und
- HLA Klasse II (HLA-DRB1, -DQB1, und -DPB1)
WES wird bei CeGaT im Paired-End-Verfahren (2 x 100 bp) mit den Sequenzierplattformen von Illumina durchgeführt. Wenn Sie andere Sequenzierparameter benötigen, lassen Sie es uns gerne wissen! Wir können Ihnen weitere Lösungen anbieten.
Weitere Informationen zu HLA Typing
Bei der HLA-Typisierung werden die verschiedenen Klassen des Haupthistokompatibilitätskomplexes (“major histocompatibility complex”, MHC) bestimmt. Das HLA-System ist die humane Version des MHC, die auch in vielen Tieren vorkommt. Die HLA-Klassen befinden sich auf verschiedenen Genloci auf Chromosom 6. Diese Gene kodieren für Zelloberflächenproteine, die das Immunsystem regulieren. Die HLA-Gene sind sehr polymorph: Viele verschiedene Allele ermöglichen die Feinabstimmung des adaptiven Immunsystems. Die von diesen Genen kodierten Proteine werden auch als Antigene bezeichnet.
Die HLA-Klasse I ist auf allen menschlichen Zellen vorhanden, die einen Zellkern besitzen. Die höchste Konzentration von Klasse-I-Antigenen findet sich jedoch auf Lymphozyten und Makrophagen. HLA-Klasse I präsentiert Peptide aus dem Inneren der Zellen. Diese Peptide werden durch das Proteasom verdaut, abgebaut und anschließend auf der Zelloberfläche präsentiert. Diese Peptide haben in der Regel eine Länge von acht bis zehn Aminosäuren. Es werden jedoch nicht nur zelleigene Peptide präsentiert: Wenn eine Zelle mit einem Virus infiziert wurde, präsentiert das HLA-System auch verdaute Viruspeptide auf der Zelloberfläche. Diese Präsentation fremder Peptide lockt Immunzellen an, wie z. B. T-Lymphozyten, welche die infizierten Zellen identifizieren und zerstören.
Im Gegensatz zum HLA-Klasse-I-System präsentiert das HLA-Klasse-II-System den T-Lymphozyten Peptide von außen. Fremde Krankheitserreger werden von so genannten Antigen-präsentierenden Zellen und durch Phagozytose abgefangen. So befindet sich HLA-Klasse-II-Antigene z. B. auf B-Zellen, aktivierten T-Zellen oder Makrophagen. Diese Zellen verdauen den Erreger und präsentieren die Peptide über das HLA-Klasse-II-System. Aktivierte T-Lymphozyten lösen die spezifische Antikörperproduktion der entsprechenden B-Zellen aus.
Wenn dieser ausbalancierte Prozess gestört ist, können sich Krankheiten weiterentwickeln oder neuartige Krankheiten entstehen. Einige HLA-Typen werden mit Autoimmunkrankheiten in Verbindung gebracht, z. B. Diabetes Typ I, rheumatoide Arthritis, systemischer Lupus erythematodes oder Narkolepsie. Die HLA-Typisierung kann die Diagnose solcher Autoimmunkrankheiten verbessern und beschleunigen. Darüber hinaus kann die HLA-Typisierung auch für Krebs und dessen Behandlung von Bedeutung sein. Die HLA-Typisierung kann wertvolle Einblicke in die Beurteilung des Therapieansprechens auf Medikamente, einschließlich der Pharmakogenetik, und Immuntherapien zur Krebsbekämpfung, geben.
Außerdem ist die HLA-Typisierung ein grundlegender Schritt bei einer Organtransplantation. Alle Zellen, die fremde HLA-Typen aufweisen, werden als potenzielle Bedrohung erkannt und aktivieren das Immunsystem. Dies ist im Fall von Krankheitserregern sehr hilfreich. Nach einer Organtransplantation befindet sich jedoch viel Fremdmaterial im menschlichen Körper. Es besteht die Gefahr, dass diese Zellen, und damit das transplantierte Gewebe, abgestoßen werden. Je ähnlicher die HLA-Antigene der spendenden Person und der empfangenden Person sind, desto geringer ist das Risiko einer Abstoßung. Daher ist die HLA-Typisierung ein sehr wichtiger Schritt für Transplantationen.
Die HLA-Typisierung kann das Verständnis für die Funktionen und komplexen Wechselwirkungen des HLA-Systems und seine Auswirkungen auf Gesundheit und Krankheit erweitern.
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Bitte geben Sie, falls möglich, folgende Probeninformationen an: Ausgangsmaterial, Anzahl der Proben, bevorzugte Option für die Vorbereitung der Library, bevorzugte Sequenziertiefe und gewünschte bioinformatische Analysestufe.
