Die Panel-Diagnostik ermöglicht es Ihnen, klinische Verdachtsdiagnosen zu sichern, den Krankheitsverlauf zu prognostizieren und früh therapeutische Maßnahmen zu ermöglichen. Nach Identifikation der ursächlichen Variante ist es zudem möglich zielgerichtete Untersuchung von weiteren Familienmitgliedern durchzuführen.
Für möglichst hohe Aufklärungsraten umfassen alle unsere Diagnostik-Panels eine CNV-Analyse und arbeiten mit unserem einzigartigen Großpanelansatz.
Key Features
Das Ziel unserer Diagnostik-Panels ist es, die genetische Ursache der Krankheit des Patienten zu identifizieren. Die Anzahl der infrage kommenden Gene ist für viele Erkrankungen sehr groß. Um für diese Erkrankungen eine effiziente Diagnostik zu ermöglichen, haben wir unseren „Großpanelansatz“ entwickelt. Hier werden alle Gene, die differentialdiagnostisch für eine Krankheit in Betracht kommen, parallel sequenziert, anstatt sich auf die mit der Primärdiagnose assoziierten Gene zu beschränken. So wird die Wahrscheinlichkeit die genetische Ursache der Erkrankung zu identifizieren deutlich gesteigert. Unsere Daten weisen darauf hin, dass bei der Analyse kleiner Gensets 25 % der ursächlichen Varianten nicht gefunden werden.
Wir bieten für jedes unserer Diagnostik-Panels an das ganze Panel, zusätzlich zur detaillierten Auswertung des angeforderten Gensets, auf pathogene (ACMG Klasse 5) und wahrscheinlich pathogene (ACMG Klasse 4) Varianten auszuweiten.
Abbildung 1: Vergleich von Groß- und Kleinpanels
Kopienzahlvarianten (copy number variants, CNVs) können, ebenso wie einzelne Nukleotidvarianten (SNVs) und kleine Insertionen und Deletionen (INDELs), für die Erkrankung des Patienten ursächlich sein. Für eine umfängliche genetische Diagnostik ist daher eine Untersuchung von CNVs unerlässlich. Wird keine CNV-Analyse durchgeführt kann dies potentiell zu falsch negativen Ergebnissen führen. Die CNV-Analyse ist ein integraler Bestandteil unserer Diagnostik Panels und wird immer durchgeführt – sie muss nicht extra angefordert werden.
Für die technische Durchführung dieser Analyse haben wir für jedes unserer Diagnostik Panels eine Referenzkarte der zu erwartenden Abdeckung erstellt. Diese Referenzkarte basiert auf unserer in-house Datenbank mit einer fünfstelligen Anzahl an Proben. Die Ergebnisse der einzelnen Analyse werden mit den Erwartungen verglichen (siehe Abbildung 2). Unsere CNV-Analyse erreicht eine Sensitivität von > 81 % für einzelne Exon-Deletionen und > 96 % Deletionen von drei oder mehr Exons. Gefundene Deletionen werden über eine zusätzliche Methode (z.B. MLPA oder qPCR) validiert.
Im Rahmen unserer Diagnostik werden für alle Diagnostik Panel immer einzelne Nukleotidvarianten (SNVs), kleinen Insertionen und Deletionen (INDELs), Kopienzahlvarianten (CNVs), bekannt pathogene intronische Varianten und phänotyp-assoziierten mtDNA-Hotspots untersucht.
Abbildung 2: Methodik der CNV-Analyse