Die Anzahl der in einer Exom-Diagnostik gefundenen Varianten ist sehr hoch. Um deren Interpretation zu beschleunigen und zu fokussieren werden das Krankheitsbild und die Symptome des Patienten so exakt wie möglich erfasst. Ein Team aus Wissenschaftlern und Fachärzten für Humangenetik erstellt eine individuelle Liste von Kandidatengenen, die alle bekannten, mit dem Krankheitsbild des Patienten assoziierten Gene, erfasst. Im Rahmen der Einzel-Exom-Diagnostik werden dann die in diesen Kandidatengenen detektierten Varianten bewertet, die Ergebnisse und deren Interpretation in einem medizinischen Befund zusammengefasst und dem behandelnden Arzt übermittelt.

Um ursächliche Varianten noch gezielter zu identifizieren ist oft eine Trio-Exom-Diagnostik sinnvoll. Hierbei werden neben dem Patienten auch die Eltern in die Analyse einbezogen und somit eine exomweite Segregationsanalyse durchgeführt. Die so erhaltenen Segregationsinformationen zu jeder Variante erlauben diese zusätzlich zu filtern und damit zielgerichteter auszuwerten. Es konnte gezeigt werden, dass die diagnostische Aufklärungsrate, von etwa 21 % für die einzelne Exom-Diagnostik auf 37 % im Falle der Trio Exom Analyse, signifikant erhöht werden kann (Farwell et al., 2015). Diese höheren Aufklärungsraten kommen zustande, da die Trio-Exom-Diagnostik:

• die bessere Identifizierung und Interpretation von bisher klinisch mit der Erkrankung nicht assoziierten Genen und Varianten ermöglicht und
• die Detektion von ursächlich häufigen, neu entstandenen (de novo) Mutationen entscheidend verbessert.

Sie ist dabei besonders zeit- und kosteneffektiv, da die zu bewertende Anzahl von Varianten minimiert wird und zahlreiche Segregationsanalysen einzelner Varianten mittels Sanger-Sequenzierung vermieden werden können.

Um eine (Trio-)Exom-Diagnostik durchzuführen, bedarf es der Aufklärung des Patienten (und ggf. der Familienangehörigen) nach Gendiagnostikgesetz (GenDG).