CeGaT erweitert die Datengrundlage aller Diagnostik-Panels

Auf Basis unserer von Experten entwickelten, hauseigenen Exom-Anreicherung „CeGaT Exome Xtra“ erweitern wir die Datengrundlage aller Diagnostik-Panels und bieten damit die neuste Innovation als Standard an. Da CeGaTs Exome Xtra Anreicherung nicht nur alle proteinkodierenden Bereiche, sondern auch alle bekannten pathogenen intronischen und intergenischen Varianten abdeckt, liefert sie die umfänglichste Datengrundlage für die beste genetische Diagnostik. Die Auswertung kann flexibel um weitere Gensets ergänzt werden und steigert dadurch die Lösungsrate auch für Patientinnen und Patienten mit komplexen Phänotypen.

Als Pioniere im Bereich der Gendiagnostik hat CeGaT vor mehr als einem Jahrzehnt Genpanels in der klinischen Gendiagnostik etabliert. Diese wurden unter Verwendung der neuesten Forschungsergebnisse und in enger Zusammenarbeit mit Expertinnen und Experten aus dem Bereich der Medizin kontinuierlich weiterentwickelt. CeGaTs neueste Innovation verbindet diese langjährige Erfahrung im Bereich der genetischen Diagnostik in einem umfassenden Produkt. CeGaT Exome Xtra deckt alle bekannten krankheitsverursachenden Regionen des gesamten Genoms ab und liefert damit die beste Datengrundlage für die Analyse unserer Diagnostikpanels. Einen detaillierten Vergleich finden Sie in unserer Tech Note „The Best Possible Exome“.

Für CeGaTs Diagnostik-Panels ergibt sich daraus:

  • Die Anreicherung erfolgt auf Exom Basis mittels CeGaT Exome Xtra
  • Die Abdeckung krankheitsrelevanter intronischer Varianten wurde deutlich gesteigert
  • Neue Gene können noch schneller integriert werden
  • Einzelnukleotidvarianten (SNVs), kleinen Insertionen und Deletionen (INDELs) sowie Kopienzahlvarianten (CNVs) werden interpretiert
  • Mosaizismen können identifiziert werden
  • Komplexe Phänotypen können aufgrund der hohen Flexibilität in der Auswertung ideal berücksichtigt werden
  • Die Möglichkeit zur Erweiterung des medizinischen Befundes um pharmakogenetische Informationen zur individuellen Medikamentenwirksamkeit
  • Die Möglichkeit zur Erweiterung des medizinischen Befundes um ACMG Gene

Mit CeGaT Exome Xtra als Datengrundlage der Panel-Diagnostik profitieren Patientinnen und Patienten, sowie die behandelnden Ärztinnen und Ärzte von einem einzigartigen Ansatz, der eine neue Dimension der Gendiagnostik erschließt.

Wir freuen uns, Ihnen die umfassendste Diagnostik, basierend auf den neusten Forschungsergebnissen, ab sofort als neuen Standard bereitstellen zu können. Zur Gewährleistung unserer hohen Qualität und Flexibilität führen wir alle Arbeitsschritte bei uns im Haus durch.

Für weitere Informationen stehen wir Ihnen gerne unter sales@cegat.de beratend zur Seite.

Weitere Informationen über unsere Diagnostikpanels

Update des Diagnostik-Panels für neuromuskuläre Erkrankungen

Im Rahmen der regelmäßigen Panel-Updates hat CeGaT das Panel für neuromuskuläre Erkrankungen (NMD) entsprechend der aktuellen wissenschaftlichen Datenlage aktualisiert und erweitert. Zusätzliche 33 Gene sind hinzugekommen: Sie steigern die Wahrscheinlichkeit, die kausale Variante zu identifizieren, und decken weitere Krankheitsbilder ab.

Zu den neu aufgenommenen Genen zählt das Sorbitol-Dehydrogenase-Gen (SORD). In der aktuellen Veröffentlichung von Cortese und Kollegen1 konnte gezeigt werden, dass Varianten in diesem Gen die häufigste identifizierte Ursache für eine autosomal-rezessiv vererbte Neuropathie sind. Durch die Aufnahme des Gens im Panel können deutlich mehr Diagnosen gestellt werden. Damit einher gehen laut aktueller Studien neue therapeutischen Möglichkeiten, die sich für die behandelnden Ärztinnen und Ärzte ergeben.

Nach dem Update enthält das Gen-Set zu Arthrogrypose (NMD14) des Panels 14 weitere Gene und deckt nun auch die beiden Krankheitsbilder der fetalen Akinesie und kongenitalen Kontraktursyndromen ab. Arthrogrypose bezeichnet die bei einer Vielzahl von oft schweren Krankheitsbildern auftretende Symptomatik von kongenitalen Gelenkkontrakturen in mindestens zwei Körperregionen.

Alle CeGaT-Panels werden im Großpanelansatz untersucht. Wir sequenzieren stets alle Gene eines Panels und werten das angeforderte Genset aus. Bei Bedarf können wir die Auswertung schnell auf andere Gensets ausweiten. Damit erhalten Sie Zugriff auf eine flexible und kosteneffiziente Differenzialdiagnostik. Darüber hinaus bieten wir ein Screening aller differenzialdiagnostisch relevanten Gene des Panels auf Varianten der ACMG-Klassen 4 und 5 an. CeGaTs Panel-Diagnostik beinhaltet zudem die kostenlose regelmäßige Neubewertung von Varianten unklarer klinischer Signifikanz (VUS), um die diagnostische Ausbeute weiter zu steigern.

Wir sind überzeugt, dass alle Patientinnen und Patienten die bestmögliche Diagnostik erhalten sollten. Daher untersuchen wir bei unseren Panels standardmäßig Einzelnukleotid-Varianten (single nucleotide variation, SNVs) sowie Kopienzahlvarianten (copy number variants, CNVs) und prüfen auf Mosaizismen. Wir validieren gegebenenfalls pathogene Deletionen oder Duplikationen mittels MLPA oder qPCR, bevor wir den Befund erstellen. Die höchste Qualität ist unser Standard.

Für weitere Informationen zum Panel stehen wir Ihnen unter sales@cegat.de beratend zur Seite. Das neue Panels kann hier angefordert werden.

1 Cortese, A., Zhu, Y., Rebelo, A.P. et al. Biallelic mutations in SORD cause a common and potentially treatable hereditary neuropathy with implications for diabetes. Nat Genet 52, 473–481 (2020). https://doi.org/10.1038/s41588-020-0615-4

Update des Panels für erbliche Tumorerkrankungen (CAN)

Prävention ist die wichtigste Maßnahme in der Bekämpfung von schwerwiegenden Tumorerkrankungen. Jeder fünfte Tumor entsteht aufgrund einer erblichen Veranlagung. Diese zu kennen und entsprechende Früherkennungsuntersuchungen in die Wege leiten zu können ist ein zentraler Baustein in der Verhinderung metastasierter und zu spät erkannter Krankheitsverläufe.

Die CeGaT hat sich seit ihrer Gründung im Jahr 2009 auf eine umfassende Großpaneldiagnostik spezialisiert. Im Tumorbereich verfolgen wir weiterhin einen panelbasierten Ansatz, da wir hier höchstmögliche Sensitivität erlangen und damit höchstmögliche Sicherheit in der Aufklärung erblicher Veranlagungen für Tumorerkrankungen. Wir sequenzieren immer alle Gene des Tumorpanels parallel und werten das entsprechend der Indikation angeforderte Genset priorisiert aus. Erblicher Brust- und Eierstockkrebs, erblicher Darmkrebs, erblicher Bauchspeicheldrüsenkrebs und erbliches Prostatakarzinom gehören zu den am häufigsten angeforderten Indikationen. Aber auch seltene Tumorerkrankungen wie Hirntumore, Hauttumore oder endokrine Tumore können erblich bedingt sein.

In Anlehnung an für den Patienten relevante wissenschaftliche Erkenntnisse hat die CeGaT nun entsprechend ihres regelmäßigen Turnus erneut die eigene Tumordiagnostik erweitert, technisch optimiert und neue Gensets in das Tumorgroßpanel für erbliche Tumorerkrankungen (CAN) aufgenommen. Unser aktuelles Update erweitert somit die Einsatzmöglichkeiten des Panels in der Keimbahndiagnostik, mit der erbliche Krebsveranlagungen sicher und schnell erkannt werden können.

Sechs zusätzliche Tumorentitäten werden nun zu den bereits untersuchten Indikationen durch das Panel mit abgedeckt:

  • Gastrointestinale Stromatumore (CAN15)
  • Gastrointestinale neuroendokrine Neoplasie (CAN16)
  • Schilddrüsenneoplasien (CAN17)
  • Lungentumore (CAN18)
  • Harnwegstumore (CAN19)
  • Basalzellkarzinome (CAN20)

Der Nachweis von pathogenen und damit möglicherweise krankheitsursächlichen Varianten in den von uns untersuchten Genen ist für die Früherkennung und die Therapie der Betroffenen ebenso relevant wie für die prädiktive Diagnostik bei gesunden Familienangehörigen.

Durch unsere Diagnostik erhalten Sie Zugriff auf eine maximal umfassende, mit höchstmöglicher diagnostischer Sensitivität durchgeführter flexibler und kosteneffizienter Differenzialdiagnostik aus einem national (durch die DAkkS) und international (durch CAP/CLIA) akkreditierten Labor. Bei Bedarf können wir die Analyse schnell auch jederzeit nach individueller Beratung auf andere Gensets ausweiten. Darüber hinaus bieten wir ein „all inklusive“ Screening aller differenzialdiagnostisch relevanten Gene des Panels auf Varianten der ACMG-Klassen 4 und 5 an insofern eine Indikation in einer Familie nicht einem Genset zugeordnet werden kann. CeGaTs Diagnostik beinhaltet zudem die jederzeit anfragbare kostenlos verfügbare regelmäßige Neubewertung von Varianten unklarer klinischer Signifikanz (VUS), um die Betreuung der Familien auch im Verlauf zu gewährleisten und auch um perspektivisch die diagnostische Klärungsrate weiter zu steigern. Die Keimbahndiagnostik berücksichtigt einzelne Nukleotidvarianten (single-nucleotide variant, SNVs), kleine Insertionen und Deletionen (INDELs) und Kopienzahlveränderungen von einzelnen und / oder mehreren Exons (copy number variants, CNVs). Für jedes in den Gensets enthaltene Gen analysieren wir alle kodierenden Regionen sowie bekannte pathogene intronische Varianten.

Bei Varianten unklarer Signifikanz empfehlen wir zudem die Durchführung einer somatischen Tumordiagnostik aus dem Tumorgewebe betroffener Familienangehöriger. Kontaktieren Sie uns mit Fragen jederzeit gern. Wir stehen Ihnen unter sales@cegat.de zur Verfügung. Das neue Panel kann hier angefordert werden.

Update der Panels für Blutbildungs- und Immundefekte

CeGaT hat die Diagnostik-Panels für Blutbildungsdefekte (BLD) und für Immundefekte (PID) auf den neuesten Stand der Wissenschaft gebracht und so deren diagnostische Sensitivität erhöht. Im Rahmen der Updates wurden die Zusammensetzung und die Strukturierung der Panels überarbeitet, um die abgedeckten Krankheitsbilder noch stärker voneinander abzugrenzen. Ärztinnen und Ärzten wird so eine optimierte Differenzialdiagnostik für ihre Patientinnen und Patienten ermöglicht.

Update des Panels für Blutbildungsdefekte (BLD)

Im Panel für Blutbildungsdefekte (BLD) wurde das Genset zu Thrombozytopenie (BLD-02) wie folgt aufgeteilt:

  • Defekte der Blutgerinnung mit Blutungsneigung (BLD-03)
  • Defekte der Blutgerinnung mit Thromboseneigung (BLD-04)

Dadurch wurden neue differenzialdiagnostische Optionen geschaffen. Die nun sechs statt fünf Gensets des Panels wurden dementsprechend neu nummeriert.

Update des Panels für Immundefekte (PID)

Im Panel für Immundefekte sind zusätzliche Gensets aufgenommen worden. Die bestehenden Gensets wurden dabei optimiert: Das Panel ist nun unterteilt in Autoinflammationssyndrome bzw. Autoimmunerkrankungen (AID) und Primäre Immundefizienzen (PID). Diese neue Strukturierung hilft, Phänotypen besser einzugrenzen und die geeignetste Diagnostik zu bestimmen.

Autoinflammationssyndrome und Autoimmunerkrankungen (AID)

Die Gensets zu Autoimmunerkrankungen und autoinflammatorischen Erkrankungen decken Erkrankungen ab, bei denen das Immunsystem des Körpers fehlgesteuert ist und Immunantworten gegen körpereigene Stoffe bzw. eine dysregulierte Inflammationsantwort initiiert. Dank neuer Gensets deckt das Panel nun folgende weitere Erkrankungen ab:

  • Defekte der regulatorischen T-Zellen und IPEX-like Phänokopien
  • Inflammation mit Leitsymptomatik im Binde- und Stützgewebe
  • Typ-I-Interferonopathien und Differenzialdiagnosen
  • Immundysregulation im Rahmen von syndromalen Krankheitsbildern

Immundefekte (PID)

Mit den Gensets zu primären Immundefekten werden Immunschwächen untersucht, die zu Infektionsneigungen unterschiedlicher Schwere führen können. Die 16 Gensets des Panels können Erkrankungen nachweisen wie:

  • Primäre Antikörperdefizienzen
  • Schwere kombinierte Immundefizienz (SCID), auch im Rahmen des NG-Screenings
  • Hyper-IgE-Syndrom und Differenzialdiagnosen
  • Adaptive Immundefizienz im Rahmen von Syndromen
  • Infektneigung: Mykrobakterielle Infektionen
  • Infektneigung: Virale Infektionen
  • Generalisierte Verrucosis
  • Defekte in für Immunantworten wichtige Signalwege

Panel-Update in Kooperation mit Partnern aus Praxis und Forschung

Die Panel-Updates wurden gemeinsam mit Kooperationspartnern an den Unikliniken Freiburg, Düsseldorf und dem Helios Klinikum Krefeld entwickelt. Prof. Dr. med. Stefan Ehl hilft uns weiterhin bei der Betreuung von ALPS und allgemeinen AID-Fällen, Prof. Dr. med. Klaus Warnatz bei CVID- und B-Zelldefizienz-Fällen.

Alle CeGaT-Panels werden im Großpanelansatz untersucht. Wir sequenzieren stets alle Gene eines Panels und werten das angeforderte Genset aus. Bei Bedarf können wir die Auswertung schnell auf andere Gensets ausweiten. Damit erhalten Sie Zugriff auf eine flexible und kosteneffiziente Differenzialdiagnostik. Darüber hinaus bieten wir ein Screening aller differenzialdiagnostisch relevanten Gene des Panels auf Varianten der ACMG-Klassen 4 und 5 an. CeGaTs Panel-Diagnostik beinhaltet zudem die kostenlose regelmäßige Neubewertung von Varianten unklarer klinischer Signifikanz (VUS), um die diagnostische Ausbeute weiter zu steigern.

Wir sind überzeugt, dass alle Patientinnen und Patienten die bestmögliche Diagnostik erhalten sollten. Daher untersuchen wir bei unseren Panels standardmäßig Einzelnukleotid-Varianten (single nucleotide variation, SNVs) sowie Kopienzahlvarianten (copy number variants, CNVs) und prüfen auf Mosaizismen. Wir validieren gegebenenfalls pathogene Deletionen oder Duplikationen mittels MLPA oder qPCR, bevor wir den Befund erstellen. Die höchste Qualität ist unser Standard.

Für weitere Informationen zu den Panels stehen wir Ihnen unter sales@cegat.de beratend zur Seite. Die neuen Panels können hier (BLD) und hier (PID) angefordert werden.

Neuer Service: CeGaTs Diagnostik-Panel für Fertilität identifiziert genetische Ursachen von Unfruchtbarkeit

Der genetische Unfruchtbarkeitstest der CeGaT zielt darauf ab, den Grund für unfreiwillige Kinderlosigkeit zu finden. Eine entsprechende Diagnose verschafft den Betroffenen Klarheit. Zudem können die behandelnden Ärztinnen und Ärzte darauf aufbauend die Chancen auf Nachwuchs verbessern.

Wer seit langem vergeblich versucht, eine Familie zu gründen, erlebt einen enormen psychischen Druck, emotionales Leiden und finanzielle Belastung. Für die Lebensqualität ist es daher entscheidend, dass die Ursache so früh wie möglich erkannt wird.

Schätzungen zufolge sind bis zu 10 Prozent unfreiwilliger Kinderlosigkeit genetisch bedingt, wie etwa durch erbliche Hormonstörungen. CeGaT bietet jetzt eines der umfassendsten genetischen Diagnostik-Panels für weibliche und männliche Unfruchtbarkeit an. Mit 141 Genen umfasst es alle nach dem aktuellen Stand der Wissenschaft bekannten relevanten Gene. Sie sind in elf Gen-Sets unterteilt, um die häufigsten Krankheitsbilder abzudecken, die zu genetisch bedingter Unfruchtbarkeit oder wiederholtem Schwangerschaftsverlust führen:

  • Primäre Ovarialinsuffizienz (FER01)
  • Vorzeitige Ovarialinsuffizienz (FER02)
  • Ovarialdysgenesie (FER03)
  • Habituelle Abortneigung, Embryonenverlust und Trombophilie (FER04)
  • Angeborene Schilddrüsenfunktionsstörungen (FER05)
  • Azoospermie (FER06)
  • Oligozoospermie (FER07)
  • Oligo-Astheno-Teratozoospermie (FER08)
  • Irregulär geformte Spermien und Flagellumanomalien (FER09)
  • Hypogonadotroper Hypogonadismus mit oder ohne Anosmie (FER10)
  • Hypophyseninsuffizienz (FER11)

Wenn die behandelnden Ärztinnen und Ärzte die genetische Ursache kennen, können sie das optimale Verfahren bestimmen, mit dem der Wunsch nach einem Kind hoffentlich erfüllt werden kann. Dazu gehören individuell abgestimmte Hormontherapien oder künstliche Befruchtungsverfahren. Aussichtslose Ansätze können im Vornherein ausgeschlossen werden.

Das Fertilitäts-Panel der CeGaT ist auch für Familien relevant, in denen genetische Unfruchtbarkeit diagnostiziert wurde. Familienmitglieder mit Kinderwunsch können ihre eigene genetische Veranlagung testen lassen, bevor sie versuchen, eine Familie zu gründen. Weitere Informationen zum Panel für Fertilität finden Sie hier.

Standardmäßig führen wir für jedes angeforderte Panel eine Kopienzahlanalyse durch – ohne zusätzliche Kosten. Wir validieren gegebenenfalls pathogene Deletionen oder Duplikationen mittels MLPA oder qPCR, bevor wir den Befund erstellen. Die höchstmögliche Qualität ist unser Standard in der Diagnostik.